Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms