Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms