Protein–RNA interactions for Protein: P29351

Ptpn6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn6P29351 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn6P29351 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms