Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms