Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms