Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxraP28700 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxraP28700 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms