Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BgnP28653 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BgnP28653 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BgnP28653 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BgnP28653 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms