Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms