Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms