Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Defa5P28312 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa5P28312 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms