Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms