Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CftrP26361 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CftrP26361 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CftrP26361 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CftrP26361 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CftrP26361 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CftrP26361 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CftrP26361 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CftrP26361 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CftrP26361 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CftrP26361 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CftrP26361 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CftrP26361 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CftrP26361 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CftrP26361 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CftrP26361 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CftrP26361 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CftrP26361 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CftrP26361 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CftrP26361 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CftrP26361 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CftrP26361 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CftrP26361 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CftrP26361 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CftrP26361 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CftrP26361 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CftrP26361 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CftrP26361 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CftrP26361 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CftrP26361 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CftrP26361 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CftrP26361 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CftrP26361 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CftrP26361 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CftrP26361 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CftrP26361 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CftrP26361 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CftrP26361 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CftrP26361 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CftrP26361 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CftrP26361 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CftrP26361 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CftrP26361 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CftrP26361 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CftrP26361 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CftrP26361 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CftrP26361 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CftrP26361 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CftrP26361 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CftrP26361 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CftrP26361 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CftrP26361 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CftrP26361 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CftrP26361 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CftrP26361 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CftrP26361 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CftrP26361 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CftrP26361 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CftrP26361 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CftrP26361 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CftrP26361 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms