Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnna1P26231 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms