Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RdxP26043 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RdxP26043 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RdxP26043 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RdxP26043 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RdxP26043 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RdxP26043 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RdxP26043 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RdxP26043 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RdxP26043 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RdxP26043 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RdxP26043 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RdxP26043 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RdxP26043 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RdxP26043 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RdxP26043 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RdxP26043 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RdxP26043 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RdxP26043 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms