Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms