Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clk1P22518 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms