Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gna11P21278 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gna11P21278 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gna11P21278 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gna11P21278 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gna11P21278 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gna11P21278 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gna11P21278 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms