Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a1P19437 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms