Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NefhP19246 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NefhP19246 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NefhP19246 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NefhP19246 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NefhP19246 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NefhP19246 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NefhP19246 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NefhP19246 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NefhP19246 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NefhP19246 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NefhP19246 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NefhP19246 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NefhP19246 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NefhP19246 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NefhP19246 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NefhP19246 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms