Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CtsdP18242 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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