Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata1P17679 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms