Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgfr1P16092 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms