Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp53P15975 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp53P15975 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp53P15975 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp53P15975 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms