Protein–RNA interactions for Protein: P15973

Phxr1, Putative per-hexamer repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phxr1P15973 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phxr1P15973 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms