Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtcP11725 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtcP11725 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtcP11725 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtcP11725 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtcP11725 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtcP11725 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtcP11725 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtcP11725 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtcP11725 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtcP11725 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtcP11725 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtcP11725 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtcP11725 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtcP11725 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtcP11725 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtcP11725 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtcP11725 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtcP11725 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms