Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms