Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms