Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms