Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms