Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms