Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtaP09225 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LtaP09225 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtaP09225 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtaP09225 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtaP09225 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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