Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxb7P09024 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb7P09024 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb7P09024 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb7P09024 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb7P09024 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb7P09024 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb7P09024 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb7P09024 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms