Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms