Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms