Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-T23P06339 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-T23P06339 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms