Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01755 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01755 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms