Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01740 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01740 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01740 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01740 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01740 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01740 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01740 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01740 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms