Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms