Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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