Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BlmO88700 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BlmO88700 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BlmO88700 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BlmO88700 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BlmO88700 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BlmO88700 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BlmO88700 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BlmO88700 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BlmO88700 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BlmO88700 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BlmO88700 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BlmO88700 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BlmO88700 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BlmO88700 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BlmO88700 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BlmO88700 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BlmO88700 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BlmO88700 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BlmO88700 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BlmO88700 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BlmO88700 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BlmO88700 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BlmO88700 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BlmO88700 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BlmO88700 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BlmO88700 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BlmO88700 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BlmO88700 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BlmO88700 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BlmO88700 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BlmO88700 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BlmO88700 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BlmO88700 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BlmO88700 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BlmO88700 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BlmO88700 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BlmO88700 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BlmO88700 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BlmO88700 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BlmO88700 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BlmO88700 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BlmO88700 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BlmO88700 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BlmO88700 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BlmO88700 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BlmO88700 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BlmO88700 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BlmO88700 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BlmO88700 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BlmO88700 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BlmO88700 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BlmO88700 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BlmO88700 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BlmO88700 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BlmO88700 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms