Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt1O88346 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms