Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Col5a1O88207 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Col5a1O88207 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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