Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd46O88174 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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