Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtssO70370 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtssO70370 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtssO70370 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtssO70370 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtssO70370 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtssO70370 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtssO70370 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtssO70370 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtssO70370 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtssO70370 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtssO70370 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtssO70370 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms