Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RngttO55236 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RngttO55236 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
RngttO55236 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RngttO55236 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RngttO55236 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms