Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChkbO55229 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ChkbO55229 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChkbO55229 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms