Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2a2O55143 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms