Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap2O55126 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms