Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms