Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dsg2O55111 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms